県立美吹西高校に通う少年、柳川聖助は、ある日の学校帰り、土でできた謎の怪物に襲われる。しかしそこに風を自在に操る少女、薊宮（あざみや）杏子が現れ、命を救われる。
　彼女は、「風神勢力」という組織に属する異能力者の１人。風の能力を無効化する『凪の秘術』の使い手を奪い合って、敵対する「地神勢力」と抗争をくり広げていた。異能の力に憧れていた聖助は、凪の秘術の使い手を捜す協力をすることに。